обновление делаю так:
сначала создаю каталоги
Код:
/repo/install /repo/update
соответственно, в /repo/install копирую содержимое диска, с которого устанавливалась система
а в /repo/update копирую содержимое образа обновления.
эти два каталога прописываю в sources.list
в графике astra-update ставлю галки "не искать установочный диск", "обновлять из репозиториев".