Посмотрел логи, ничего явно намекающего на источник проблемы. Но, похоже, рабочий стол не запускается из-за ошибки демона user@1000:
systemctl status user@1000
● user@1000.service - User Manager for UID 1000
Loaded: loaded (/lib/systemd/system/user@.service; static; vendor preset: enabled)...