Не будет. Просто место на диске эти ядра займут. Поэтому проще установить "нужное" ядро, загрузиться с этим ядром, запустить VMW, перезагрузиться, снова загрузиться с этим ядром и проверить работу VMW. Если не заработает, то удалить "нужное" ядро, перезагрузиться и , снова установить "нужное"...