А на флешках какие файловые системы? У меня была похожая проблема и несколько раз. Не помню как решал. Но если на флешках нет каких нибудь важных данных и чего то что не жаль потерять то можно попробовать отформатировать хотя бы одну и посмотреть... правда у меня это было на Орле. Если обычное форматирование не поможет то отформатируйте с помощью Gparted в файловую систему Linux, например ext4.