Ну наконец то, теперь появилась версия под Линукс.
Главное отличие: теперь программа запоминает распахнутые окна и не нужно их каждый раз разворачивать!
Установил на свежую гостевую систему. Такой проблемы не было. И все таки было бы неплохо если бы кто нибудь подсказал как решить вышеописанную проблему. Может кто подскажет.